Techniques classiques de biochimie
- SDS-PAGE, gel natif, gel bleu natif (pour supercomplexe membranaire), Western-Blot etc.
- Purification de protéines taggées ou natives : système Akta, différentes colonnes de purification
- Enzymologie, Mesure potentiel redox, oxygraphe etc.
- Interaction protein-protein: pontage covalent, gel natif, co-purification, Blitz (plateforme) etc.
- HPLC
Techniques classiques de spectroscopie
- UV-Visible
- Dichroisme circulaire
- Fluorescence
Techniques classiques de biologie moléculaire et microbiologie
- Clonage
- Mutagénèse dirigée
- Délétion de gène
- Courbe de croissance (TECAN), survie sur boites
Techniques usuelles d’électrochimie
- Voltamétrie
- Ampérométrie
- Impédance
Couplage électrochimie/techniques de surface
Un axe en développement pour l’étude fondamentale de l’enzyme immobilisée vise à coupler l’électrochimie et différentes techniques de surface, notamment la
SPR (résonance des plasmons de surface), la
QCM (microbalance à quartz) et la
microscopie de fluorescence. L’enregistrement simultané des signaux électrochimiques et des données issues des différentes techniques permettra de relier la quantité d’enzyme immobilisée à son activité, et d’interpréter l’instabilité possible d’un signal électrochimique (
e-SPR et
e-QCM), de localizer l’enzyme grâce au marquage des biomolécules par un fluorophore (
microscopie photonique), et enfin à cartographier l’activité enzymatique, en visualisant grâce à un fluorophore sensible au pH les variations locales de pH induites (
microscopie in situ). Dans le cadre de l’ANR ENZYMOR (2017-2021), la relation entre l’activité enzymatique et la conformation de l’enzyme immobilisée sera réalisée par e-PMIRRAS, en collaboration avec Sophie Lecomte (CNBM Bordeaux). Ces données seront completes par de la modélisation (Collaboration IBPC, Marc Baaden).