Techniques

Techniques classiques de biochimie

- SDS-PAGE, gel natif, gel bleu natif (pour supercomplexe membranaire), Western-Blot etc.
- Purification de protéines taggées ou natives : système Akta, différentes colonnes de purification
- Enzymologie, Mesure potentiel redox, oxygraphe etc.
- Interaction protein-protein: pontage covalent, gel natif, co-purification, Blitz (plateforme) etc.
- HPLC

Techniques classiques de spectroscopie

- UV-Visible
- Dichroisme circulaire
- Fluorescence

Techniques classiques de biologie moléculaire et microbiologie

- Clonage
- Mutagénèse dirigée
- Délétion de gène
- Courbe de croissance (TECAN), survie sur boites

Techniques usuelles d’électrochimie

- Voltamétrie
- Ampérométrie
- Impédance

Couplage électrochimie/techniques de surface

Un axe en développement pour l’étude fondamentale de l’enzyme immobilisée vise à coupler l’électrochimie et différentes techniques de surface, notamment la SPR (résonance des plasmons de surface), la QCM (microbalance à quartz) et la microscopie de fluorescence. L’enregistrement simultané des signaux électrochimiques et des données issues des différentes techniques permettra de relier la quantité d’enzyme immobilisée à son activité, et d’interpréter l’instabilité possible d’un signal électrochimique (e-SPR et e-QCM), de localizer l’enzyme grâce au marquage des biomolécules par un fluorophore (microscopie photonique), et enfin à cartographier l’activité enzymatique, en visualisant grâce à un fluorophore sensible au pH les variations locales de pH induites (microscopie in situ). Dans le cadre de l’ANR ENZYMOR (2017-2021), la relation entre l’activité enzymatique et la conformation de l’enzyme immobilisée sera réalisée par e-PMIRRAS, en collaboration avec Sophie Lecomte (CNBM Bordeaux). Ces données seront completes par de la modélisation (Collaboration IBPC, Marc Baaden).